Christian Karlsen har jobbet med de fleste av verdens fremsta tonsettere, deriblant Polarpristagarna Steve Reich, Kaija Saariaho og Sofia Gubajdulina. Han er kanskje mest kjent som en av Europas fremste dirigenter av samtidsmusikk, men er like hjemme i det tradisjonelle repertoaret og er spesielt hyllet for sin tolkning av Mozart og Haydn. Karlsen har samarbeidet med blant andre hr-Sinfonieorchester, Nederlandsk radios symfoniorkester, Göteborgs Symfoniker, Kungliga Filharmonikerna og Amsterdam Sinfonietta. Sesongen 2019–2020 debuterte han med London Sinfonietta i Paris og Berlin.