Elise Båtnes er en norsk fiolinist. Hun er 1. konsertmester i Oslo Filharmoniske Orkester og professor ved Norges Musikkhøgskole.
I Norge studerte Båtnes med Kåre Opdal ved Trondheim kommunale musikkskole og senere med Arve Tellefsen. Videre studier var med Dorothy DeLay, Ruggiero Ricci og David Takeino. Selv sier hun at den største musikalske innflytelsen fikk hun gjennom Oslo Filharmoniske Orkester og dirigenten Mariss Jansons.
Hun har vært tilknyttet Det Norske Kammerorkester og i perioden 1995–1997, var hun medlem av Vertavokvartetten. I 1997 ble hun konsertmester og kunstnerisk leder for det nystartede Bergen Kammerensemble. Båtnes har vært solist med alle de norske symfoniorkestrene i tillegg til ledende orkestre ellers i Europa.
Ved siden av sin orkestervirksomhet har hun også deltatt på kammermusikkfestivalene i Oslo, Risør og Stavanger og gjestet Festspillene i Bergen, Festspillene i Elverum og Olavsdagene i Trondheim. Som medlem av Vertavokvartetten har hun mottatt flere priser, blant andre Spellemannprisen i 1996 for Carl Nielsens strykekvartetter på Simax. Elise Båtnes spiller på en Antonio Stradivari/Cremona fra 1689.