Tõnu Kaljuste, født i Tallinn (Estland) i 1953, er sønn av Heino Kaljuste, som var en ledende estisk kordirigent og pedagog. Tõnu Kaljuste spesialiserte seg tidlig på kordireksjon og studerte ved både Tallinn konservatorium og det som i dag er St. Petersburg-konservatoriet. I 1981 startet han sin profesjonelle karriere på fulltid etter at hans Ellerhein kammerkor vant førsteprisen i Béla Bartók internasjonale korkonkurranse, noe som førte til statlig finansiering av koret, som deretter fikk navnet Estonian Philharmonic Chamber Choir.
